在大型機構服務方面，蘆洲清水溝的實力同樣備受肯定，學校、醫院、商業大樓的排水管網複雜，涵管、化糞池等設施若長期缺乏保養，容易堆積泥沙、廢土甚至塑膠垃圾，導致雨季來臨時排水不暢，嚴重時可能引發地下室淹水，蘆洲清水溝團隊具備豐富的大型工程經驗，曾多次受政府單位委託，參與社區水溝清淤、道路涵管疏通等公共項目。施工過程中，技術人員會先進行現場勘察，制定詳細清理計畫，並搭配抽污車、挖掘機等重型設備，確保泥沙、廢棄物被徹底清除，同時嚴格遵守環保規範，避免二次污染。
工廠廢水池長期堆積重金屬沉澱、化學殘渣，處理不當將面臨環保罰款風險。蘆洲清水溝具備危險廢物處理許可證，針對電子廠、五金廠等行業，提供廢水澄清+污泥固化+資源回收一條龍服務。曾協助某PCB廠處理含銅廢水池，通過化學沉澱法回收銅資源，減少廢棄物處置成本40%，同時達到環保排放標準。